Galvenā atšķirība starp ģenētisko saikni un saites līdzsvara trūkumu ir tāda, ka ģenētiskā saikne ir divu vai vairāku vienas un tās pašas hromosomas gēnu tendence palikt kopā mantojuma procesā, savukārt saites līdzsvara trūkums ir nejauša alēļu saistība dažādos lokos populācijā.
Ģenētiskā saikne un saites līdzsvara trūkums ir divi ģenētikas jēdzieni, kas seko mantojumam, kas nav Mendeli. Ģenētiskā saikne attiecas uz fizisko stāvokli, kad ir saistīta hromosomā. Vienkārši sakot, tas ir process, kurā gēni atrodas cieši hromosomā tā, ka tie vienmēr tiek mantoti kopā gametās. No otras puses, populācijas ģenētikā saiknes līdzsvara trūkums attiecas uz nejaušām alēļu saistībām dažādos lokusos populācijā. Tas ir starpības mērs starp novēroto atsevišķas alēļu kombinācijas biežumu divos lokos un sagaidāmo nejaušības dēļ.
