Galvenā atšķirība starp melatonīnu un serotonīnu ir tā, ka melatonīns ir hormons, kas palīdz mums aizmigt, savukārt serotonīns ir neirotransmiteris, kas palīdz mums justies nomodā, kad pieceļamies nākamajā dienā.
Melatonīns ir neirotransmiterim līdzīga viela. Tas ir hormons, kas palielinās tumsā. Serotonīns ir neirotransmiters, kas darbojas pretēji melatonīnam. Serotonīna līmenis palielinās saules gaismā. Gan melatonīns, gan serotonīns regulē dažādas funkcijas mūsu ķermenī, piemēram, apetīti, garastāvokli un miegu. Īsāk sakot, melatonīns ir viela, kas mums palīdz iet gulēt, savukārt serotonīns ir viela, kas mums palīdz justies nomodā nākamajā rītā.