Galvenā atšķirība starp Klebsiella pneumoniae un Streptococcus pneumoniae ir tā, ka Klebsiella pneumoniae ir gramnegatīva stieņa baktērija, savukārt Streptococcus pneumoniae ir grampozitīva, nemotila un nesporcionējoša ovālas vai sfēriskas formas baktērija.
Gan Klebsiella pneumoniae, gan Streptococcus pneumoniae ir divas dažādas baktērijas, kas izraisa pneimoniju, un vairāki citi infekciju veidi. Abi baktēriju veidi ir fakultatīvi anaerobi, kas nav kustīgi. Tā kā abām šīm baktērijām rodas rezistence pret antibiotikām, to infekcijas ir grūti ārstēt.