Galvenā atšķirība starp citoplazmu un protoplazmu ir tā, ka citoplazma ir protoplazmas daļa, kas neietver kodolu, savukārt protoplazma ir šūnas dzīvais saturs, kas ietver citoplazmu un kodolu.
Šūna ir dzīvo organismu pamatvienība. Šūna satur dažādas sastāvdaļas, ieskaitot šūnu sienas un šūnu membrānas, kodolu, šūnu organellus, citoplazmu, ūdeni, dažādus šķidruma materiālus utt. Protoplazma darbojas kā dzīves fiziskais pamats, un to galvenokārt veido ūdens. Citoplazma un protoplazma ir suspensijas, kas uztur organoīdus un nodrošina vietas visu bioloģisko procesu veikšanai šūnā. Citoplazma ir protoplazmas daļa, kas ir želejveida šķidrums šūnā.