Galvenā atšķirība starp prokariotu un eikariotu transkripciju ir tāda, ka prokariotu transkripcija notiek citoplazmā, bet eikariotu transkripcija notiek kodola iekšpusē.
Šūnā DNS nes informāciju no paaudzes paaudzē, kontrolējot šūnas aktivitātes. Turklāt DNS ir atbildīga par visu olbaltumvielu sintezēšanu, kurām šūnā ir funkcionāla, kā arī strukturāla loma. Tāpēc, sintezējot šādus proteīnus, DNS kontrolē šūnas darbību. Lai sintezētu attiecīgo olbaltumvielu, būtu jāizsaka gēns, kas satur ģenētisko informāciju olbaltumvielu ražošanai. Gēnu ekspresija notiek ar diviem galvenajiem soļiem, proti, transkripciju un tulkošanu. Tādējādi transkripcija ir pirmais gēnu ekspresijas posms. Tam seko tulkošana. Transkripcijas laikā ģenētiskā informācija par DNS mRNS pārveidojas par trīs burtu ģenētiskā koda secību. Tulkošanas laikā mRNS tiek pārveidota par polipeptīdu ķēdi.
