Galvenā atšķirība starp eikariotu un prokariotu organismiem ir tā, ka eikariotu organismiem ir patiess kodols un ar membrānu saistīti organelli, savukārt prokariotu organismiem trūkst kodola un ar membrānu saistītu organellu.
Visi dzīvie organismi pieder divām kategorijām, prokariotiem vai eikariotiem. Prokariotu organismiem ir vienkārša šūnu organizācija, savukārt eikariotu organismiem - sarežģīta šūnu organizācija. Turklāt prokariotes ir vienšūnas, un tām nav kodola un ar membrānu saistītu organellu. No otras puses, eikarioti parasti ir daudzšūnu un satur patiesu kodolu un ar membrānu saistītus organellus, piemēram, hloroplastus, mitohondrijus un endoplazmas retikulumu utt. Prokariotos ir baktērijas un Archaea, savukārt eikariotos ir protisti, sēnītes, augi un dzīvnieki. Izņemot iepriekš minētās atšķirības, starp prokariotiem un eikariotiem ir vairāk atšķirību. Tāpēc ir ļoti svarīgi izprast atšķirības starp prokariotu un eikariotu organismiem. Šī raksta mērķis ir apspriest atšķirību starp eikariotu un prokariotu organismiem.
