Galvenā atšķirība starp prostaglandīnu E1 un E2 ir tā, ka prostaglandīns E1 (PGE1) ir pretiekaisuma faktors, savukārt prostaglandīns E2 (PGE2) ir iekaisumu veicinošs faktors.
Prostaglandīni ir lipīdu atvasināti savienojumi, kuriem ir hormoniem līdzīga funkcija. Tie var darboties kā autokrīni vai parakrīni savienojumi, izraisot antagonistisku vai sinerģisku efektu dzīvajos organismos. Prostaglandīns E1 un prostaglandīns E2 ir divu veidu, un tie atšķiras pēc iekaisuma funkcionalitātes. Gan prostaglandīns E1, gan E2 pieder vienai un tai pašai prostaglandīnu E2 ģimenei, un to reakcijas pamats un ietekme vēl nav pilnībā noskaidrota. Tos izmanto dažādu dzīvo būtņu bioķīmisko mehānismu ārstēšanā.