Galvenā atšķirība starp DNS-RNS hibrīdiem un dsDNS ir tā, ka DNS-RNS hibrīdi ir divvirzienu nukleotīdi, kas sastāv no vienas DNS virknes un vienas komplementāras RNS virknes, savukārt dsDNS ir divvirzienu DNS, kas sastāv no diviem komplementāriem DNS pavedieniem.
Dzimtā stāvoklī DNS ir divējāda. Tam ir divas komplementāras DNS virknes, kas saistītas ar ūdeņraža saitēm. RNS savā dabiskajā struktūrā ir vienvirziena. Dažos gadījumos RNS veido dupleksus ar DNS. Tie ir pazīstami kā DNS-RNS hibrīdi. Tie galvenokārt veidojas onkogēno RNS vīrusu transkripcijas un pavairošanas laikā. Salīdzinot ar dsDNS, DNS-RNS hibrīdi ir stabilāki.
