Galvenā atšķirība starp VNTR un zondi ir tā, ka VNTR ir īsa nukleotīdu secība, kas notiek kā tandēma atkārtojums genomā, savukārt zonde ir mākslīgi sintezēta īsa DNS vai RNS secība, ko varētu radioaktīvi iezīmēt.
VNTR nozīmē mainīga skaita tandēma atkārtojumu. Tā ir īsa nukleotīdu secība, kas sakārtota tandēma atkārtojumos genomā. VNTR ir dabiski sastopami mūsu genomā. Zonde ir mākslīgi sintezēta īsa DNS vai RNS sekvence. Gan zonde, gan VNTR ir nukleīnskābes vai īsas nukleotīdu sekvences. Viņus ļoti plaši izmanto dažādās molekulārbioloģiskajās metodēs, galvenokārt kriminālistikas pētījumos. VNTR un zondei ir dažas līdzības, kā arī atšķirības. Tādējādi rakstā mēģināts izcelt atšķirību starp VNTR un zondi.
