Galvenā atšķirība starp klonēšanas vektoru un ekspresijas vektoru ir tāda, ka klonēšanas vektors nes svešu DNS fragmentu saimniekšūnā, savukārt ekspresijas vektors atvieglo gēnu ekspresiju olbaltumvielās.
Vektors ir svarīgs termins molekulārajā bioloģijā. Rekombinantās DNS tehnoloģijā vektora galvenā loma ir nodrošināt transporta veidu uz noderīgu DNS frakciju, kas jāievieto saimniekšūnā. Turklāt tā ir DNS molekula, ko izmanto, lai svešu DNS fragmentu mākslīgi nogādātu saimnieka šūnā, lai to ekspresētu vai atkārtotu. Visbiežāk izmantotie vektori ir plazmīdas, vīrusu vektori, kosmīdi un mākslīgās hromosomas. Klonēšanas vektors un ekspresijas vektors ir divu veidu vektori, kas klasificēti, pamatojoties uz to pielietojumu.