Galvenā atšķirība - VNTR pret STR
DNS pētījumiem ir milzīga nozīme filoģenētisko attiecību izpratnē un noteikšanā, ģenētisko slimību diagnosticēšanā un organisma genomu kartēšanā. Lai identificētu konkrētu gēnu vai DNS secību nezināmas DNS baseinā, tiek izmantotas vairākas metodes, kas saistītas ar DNS analīzi. Tie ir pazīstami kā ģenētiskie marķieri. Ģenētiskos marķierus molekulārajā bioloģijā izmanto, lai identificētu ģenētiskās variācijas starp indivīdiem un sugām. Mainīga skaita tandēma atkārtojums (VNTR) un īss tandēma atkārtojums (STR) ir divu veidu ģenētiskie marķieri, kas parāda polimorfismu indivīdu vidū. Abi veidi ir nekodējoša atkārtojoša DNS, kas ir tandēma atkārtojumi. Hromosomās tie ir sakārtoti no galvas līdz astei. VNTR ir genoma sekcija, kurā īsa nukleotīdu secība tiek atkārtota vairākas reizes. STR ir vēl viena DNS sekcija genomā, kas simts reizes tiek organizēta kā atkārtotas vienības, kas sastāv no diviem līdz trīspadsmit nukleotīdiem. Galvenā atšķirība starp VNTR un STR ir nukleotīdu skaits atkārtotā secībā. Atkārtojošās VNTR vienības sastāv no 10 līdz 100 nukleotīdiem, savukārt STR atkārtojošās vienības sastāv no 2 līdz 13 nukleotīdiem. VNTR un STR tiek plaši izmantoti tiesu medicīnas pētījumos.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir VNTR
3. Kas ir STR
4. Līdzības starp VNTR un STR
5. Blakus salīdzinājums - VNTR pret STR tabulas veidā
6. Kopsavilkums
Kas ir VNTR?
Tandēma atkārtojums ir īsa DNS secība, kas tiek atkārtota no galvas līdz astei noteiktā hromosomu lokusā. Tandēma atkārtojumā nav citas sekvences vai nukleotīda. Genomā ir vairāki tandēma atkārtojumu veidi. VNTR ir tandēma atkārtojuma veids starp tiem, kam ir atkārtojošās vienības, kas sastāv no 10 līdz 100 nukleotīdiem. VNTR ir minisatelīta veids. Šos tandēma atkārtojumus var atrast daudzās hromosomās. Tie ir sakrustoti cilvēka genomā un galvenokārt atrodas hromosomu subtelomeriskajos reģionos.
VNTR liecina par tandēma atkārtotu polimorfismu indivīdu vidū. VNTR garums noteiktā hromosomas vietā indivīdu vidū ir ļoti atšķirīgs, jo šajā DNS sadaļā organizēto atkārtoto vienību skaits ir atšķirīgs. Tādēļ VNTR var izmantot kā spēcīgu instrumentu indivīdu identificēšanai, un VNTR analīzi izmanto daudzās jomās, tostarp ģenētikā, bioloģijas pētījumos, kriminālistikā un DNS pirkstu iespiešanā. VNTR bija pirmie ģenētiskie marķieri, ko izmantoja kaulu smadzeņu transplantācijas implantācijas kvantitatīvai noteikšanai. VNTR bija arī pirmie polimorfie marķieri, kas tika izmantoti DNS profilēšanā kriminālistikā.
01. attēls: VNTR variācija sešiem indivīdiem
VNTR analīzi veic, izmantojot restrikcijas fragmenta garuma polimorfismu, kam seko dienvidu hibridizācija. Tādējādi tam nepieciešams salīdzinoši liels DNS paraugs. Arī VNTR profila interpretācija ir problemātiska. Šo ierobežojumu dēļ VNTR izmantošana tiesu ģenētikā ir ierobežota, un to aizstāj ar STR analīzi.
Kas ir STR?
STR ir ļoti atkārtota DNS sekcija, kas sastāv no divām līdz trīspadsmit nukleotīdu atkārtojošām vienībām, kas sakārtotas tandēmā. STR ir līdzīgs VNTR. Bet tas atšķiras no VNTR no nukleotīdu skaita atkārtojošā secībā un atkārtojumu skaita. STR ir mikrosatelīta veids.
STR analīze ir saistīta ar precīzu atkārtojošo vienību skaita mērīšanu. STR ir ļoti atšķirīgas indivīdu vidū, līdzīgi kā VNT. STR profili katram cilvēkam atšķiras. Tāpēc molekulārajā bioloģijā tiek izmantota STR analīze, lai salīdzinātu DNS specifiskus lokusus no diviem vai vairākiem paraugiem. Tādējādi molekulārās bioloģijas apstākļos STR tiek uzskatīti par spēcīgiem ģenētiskajiem marķieriem. Tas ir lielisks līdzeklis indivīdu identificēšanai viņu augstās polimorfisma pakāpes un relatīvi mazā garuma dēļ.
Šobrīd kriminālistikas ģenētikā STR ir visbiežāk izmantotais analizētais ģenētiskā polimorfisma rīks. Lielākajā daļā kriminālistikas gadījumu ir iesaistīta STR polimorfā analīze. STR loki ir izplatīti visā genomā. Hromosomās atrodas tūkstošiem STR, kurus var izmantot tiesu ekspertīzē. STR analīze neietver ierobežojuma garuma polimorfismu, piemēram, VNTR analīzi. STR analīze negriež DNS ar restrikcijas enzīmiem. Lai pievienotu vēlamos reģionus DNS, tiek izmantotas specifiskas zondes un, izmantojot PCR tehniku, tiek noteikti STR garumi.
02. attēls: STR variācijas starp paraugiem
Kādas ir VNTR un STR līdzības?
- VNTR un STR ir nekodējama DNS.
- Abi ir tandēma atkārtojumi.
- Abi parāda polimorfismu starp indivīdiem, pateicoties atšķirībām DNS sekcijas garumā.
- Abi tiek izmantoti kā spēcīgi ģenētiskie marķieri DNS pirkstu drukāšanā un kriminālistikas pētījumos.
Kāda ir atšķirība starp VNTR un STR?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
VNTR pret STR |
|
| VNTR ir nekodējama atkārtota DNS, kurai ir īsa nukleotīdu secība, kas tiek atkārtota tandēmā. | STR ir ļoti atkārtota DNS sekcija, kas sastāv no divām līdz trīspadsmit nukleotīdu atkārtojošām vienībām, kas sakārtotas tandēmā. |
| Izmērs | |
| VNTR ir lielāki par STR. | STR ir mazāki par VNTR. |
| Nukleotīdu skaits atkārtotā secībā | |
| VNTR atkārtojošā vienība sastāv no 10 līdz 100 nukleotīdiem. | STR atkārtojošā vienība sastāv no 2 līdz 13 nukleotīdiem. |
Kopsavilkums - VNTR pret STR
VNTR un STR ir divi spēcīgi ģenētiskie marķieri, kurus izmanto molekulārajā bioloģijā, it īpaši kriminālistikas ģenētikas jomā. VNTR ir minisatelīta veids, un STR ir mikrosatelīts. VNTR un STR ir nekodējoša, ļoti atkārtojoša DNS. Tie ir tandēma atkārtojumi. VNTR un STR vispārējā struktūra ir vienāda. Tomēr nukleotīdu skaits atkārtotajā secībā un garums ir atšķirīgs. VNTR atkārtojas secības, kas sastāv no 10 līdz 100 nukleotīdiem. STR ir atkārtotas sekvences, kas sastāv no 2 līdz 13 nukleotīdiem. Šī ir atšķirība starp VNTR un STR.
Lejupielādēt VNTR vs STR PDF versiju
Jūs varat lejupielādēt šī raksta PDF versiju un izmantot to bezsaistes mērķiem, kā norādīts piezīmēs. Lūdzu, lejupielādējiet šeit PDF versiju. Starpība starp VNTR un STR.
