Galvenā atšķirība - proteomika vs transkripptika
Omiska tehnoloģija ir aktuāla tendence, kad dažādas organisma biomolekulas tiek aplūkotas kā visa kolekcija, ņemot vērā tā īpašības un funkcijas. Omiskajai tehnoloģijai ir plašs lietojumu klāsts. Bioloģiskā parauga atšķirīgā omika ietver genomiku, proteomiku, transkripptiku un metabolomiku. Proteomika ietver visu dzīvā organisma olbaltumvielu pilnīgu izpēti. To definē kā visu organismā izteikto olbaltumvielu kopumu, tā strukturālās un funkcionālās īpašības. Tādējādi proteīnu kopums veido proteomu. Transkripptika ir visu dzīvajā organismā esošo kurjera RNS (mRNS) molekulu pilnīgs pētījums. Tādējādi transkriptomātika attiecas uz gēniem, kas aktīvi izpaužas dzīvā organismā. Kopējais mRNS kopums dzīvā organismā tiek dēvēts par transkriptu. Galvenā atšķirība starp proteomiku un transkriptu ir balstīta uz biomolekulas tipu. Proteomikā tiek pētīts kopējais ekspresēto olbaltumvielu kopums dzīvā organismā, savukārt transkriptomātikā tiek pētīts dzīvā organisma kopējais mRNS.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir proteomika
3. Kas ir transkriptoģika
4. Līdzības starp proteomiku un transkriptomātiku
5. Blakus salīdzinājums - proteomika pret transkriptoģiku tabulas formā
6. Kopsavilkums
Kas ir proteomika?
Termins proteomika tika izveidots 1995. gadā un sākotnēji tika definēts kā kopējais olbaltumvielu papildinājums šūnā, audos vai organismā. Ar progresu proteomikas pētījumos tas tika modificēts, lai to uzskatītu par jumta terminu, kurā tika iekļautas daudzas studiju jomas. Pašlaik proteomikas tēmas ietvaros tiek pētīta olbaltumvielu struktūra, orientācija, funkcijas, mijiedarbība, modifikācijas, pielietojums un nozīme. Tāpēc proteomikas jomā šobrīd tiek veikti daudz pētījumu.
Pirmie proteomiskie pētījumi tika veikti, lai identificētu olbaltumvielu saturu Escherichia coli. Kopējā olbaltumvielu satura kartēšana tika veikta, izmantojot divdimensiju (2D) želejas. Pēc šī panākuma zinātnieki pārgāja uz kopējo olbaltumvielu satura raksturošanu dzīvniekiem, piemēram, jūrascūciņām un pelēm. Pašlaik cilvēka olbaltumvielu kartēšana tiek veikta, izmantojot 2D gēla elektroforēzi.
Proteomikas pielietojums
Proteomikas pētīšanai ir daudz priekšrocību, jo olbaltumvielas ir lielākās daļas aktivitātes molekulas, pateicoties olbaltumvielu katalizatoram. Tādējādi visu olbaltumvielu izpēte var sniegt informāciju par organisma veselības stāvokli. Dažas lietojumprogrammas ir;
- Genoma anotācija: pētot organisma olbaltumvielu saturu, var noteikt precīzus genomus, kas ir atbildīgi par aktīvo olbaltumvielu savienojumu. Šajā scenārijā visu genomiku rezultāti ir svarīgi, transkriptomātika un proteomika.
- Slimības identificēšana / diagnostika: Proteomiku izmanto, lai identificētu slimības stāvokli, salīdzinot veselos un slimos
- Veikt eksperimenta laikā pētīto olbaltumvielu ekspresiju.
- Olbaltumvielu modifikācijas un mijiedarbības pētījumi: Lai izmantotu olbaltumvielas in vitro apstākļos un un in vivo apstākļos, izlemtu šo ekstrakto olbaltumvielu uzglabāšanas apstākļus un pētītu olbaltumvielu uzvedību in vitro, in vivo un in-silico metodēs.
01. attēls: Proteomika
Proteomikā ir dažādas metodes
- Kopējā proteīna ekstrakcija un olbaltumvielu atdalīšana, izmantojot 2D gēla elektroforēzi. Olbaltumvielas var atdalīt arī, izmantojot augstas veiktspējas šķidruma hromatogrāfiju (HPLC).
- Ekstrahēto olbaltumvielu secība, izmantojot tādas metodes kā Edmunda sekvencēšanas metodi vai masu spektrometriju.
- Kad secības ir noteiktas, proteīnu satura strukturālās un funkcionālās īpašības tiek analizētas, izmantojot datorizētu programmatūru un bioinformātikas rīkus.
Kas ir transkriptomika?
Transkripcijas termins ir izveidots nesen. Transcriptomics ir pētījums par kopējo mRNS saturu organismā. Kopējā mRNS ir izteikta DNS dzīvā organismā vai šūnā. Pilnu mRNS kolekciju sauc par transkriptu.
Stenogrammas analīzes soļi ietver,
- RNS ekstrakcija, mRNS atdalīšana, izmantojot kolonnas gēla hromatogrāfiju ar poli DT lodītēm.
- Tiek veikta mRNS sekvencēšana.
Microarray tehnoloģija ir viens izplatīts veids, kā identificēt organisma transkripciju. Microarray tehnika ietver zondes plāksni ar transkripcijas papildinošajiem pavedieniem. Pēc hibridizācijas var raksturot mRNS, kas atrodas organismā vai šūnās.
02. attēls. Transkripptiskās metodes
Transkripptika tagad tiek plaši izmantota medicīnas jomā. Slimību diagnostika un slimību profilēšana ir galvenās jomas, kurās tiek izmantota transkriptomātika. Analizējot organisma transkripciju, var noteikt svešu mRNS, un, ja ir kādas infekcijas, to var identificēt. Nekodējošu RNS var atdalīt, izmantojot transkriptu tehnoloģijas. Un arī var kontrolēt gēnu izpausmi dažādos vides apstākļos.
Kādas ir proteomikas un transkripptikas līdzības?
- Abi ir daļa no omiskās tehnoloģijas jēdziena.
- Abi tiek izmantoti slimību diagnostikā un organisma slimību raksturošanā.
- Abās pētījuma jomās bija iesaistīta biomolekulas ekstrakcija, biomolekulas atdalīšana un sekvencēšanas soļi.
Kāda ir atšķirība starp proteomiku un transkriptomātiku?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomika ietver visu olbaltumvielu pilnīgu izpēti dzīvā organismā. | Transkripptika ir visu dzīvajā organismā esošo kurjera RNS (mRNS) molekulu pilnīgs pētījums. |
| Pētīja biomolekulu tipu | |
| Olbaltumvielas tiek pētītas proteomikā. | mRNS tiek pētīta transkriptomātikā. |
| Pētītie faktori | |
| Olbaltumvielu struktūra, funkcija, mijiedarbība, modifikācijas un pielietojums tiek pētīts proteomikā. | Transkriptomātikā tiek pētīta secības struktūra, mijiedarbība ar vidi un mRNS pielietojums. |
Kopsavilkums - Proteomika vs Transcriptomics
Omikam ir svarīga loma dzīvības zinātņu jomā. Proteomika attiecas uz proteoma izpēti, kas veido pilnīgas olbaltumvielu kolekcijas šūnā vai organismā. Transkriptiika attiecas uz transkripcijas izpēti, kas ir pilns ekspresētās DNS komplekts, kas ir mRNS formā. Abas izpētes jomas, proteomika un transkripptika, tika iegūtas pēc genomikas ieviešanas un pašlaik tiek plaši izmantotas medicīniskajā diagnostikā un organismu raksturošanā un skrīningā. Šī ir atšķirība starp proteomiku un transkripptiku.
Lejupielādējiet PDF failu Proteomics vs Transcriptomics
Jūs varat lejupielādēt šī raksta PDF versiju un izmantot to bezsaistes mērķiem, kā norādīts piezīmē. Lūdzu, lejupielādējiet PDF versiju šeit: Starpība starp proteomiku un transkriptu
