Galvenā atšķirība starp aloantivielu un autoantivielu ir tā, ka aloantiviela ir antiviela, kas ražota pret aloantigēniem, kas ir sveši antigēni, kurus ievada pārliešanas vai grūtniecības laikā. Tikmēr autoantiviela ir antiviela, kas reaģē ar pašantigēniem.
Antivielas rodas imūnās atbildes rezultātā. Tie var atspoguļot imūnās atbildes klātbūtni, raksturu un intensitāti. Imūnsistēmai jāspēj atsevišķi identificēt antigēnus un svešus antigēnus. Tā ir kritiska tās funkcijai. Imūnās sistēmas B šūnas ražo antivielas pret antigēniem. Alloantivielas un autoantivielas ir divu veidu šādas antivielas. Alloantivielas tiek ražotas sakarā ar aloantigēnu ievadīšanu organismā pārliešanas vai grūtniecības laikā. Turpretī autoantivielas ir antivielas, kas reaģē ar pašantigēniem. Autoantivielu reakcija ar pašantigēniem ir atbildīga par audu un orgānu iekaisumu, bojājumiem un disfunkciju, izraisot autoimūno traucējumu pazīmes un simptomus.
