Galvenā atšķirība starp transgēnajām un izslēgtajām pelēm ir tā, ka transgēnu pelēm ir sveši gēni, kas ievietoti tās genomā, savukārt nokautajām pelēm ir funkcionāli inaktivēts gēns.
Gēnu inženierija ir ģenētikas joma, kurā organisma ģenētiskais sastāvs tiek modificēts vai manipulēts ar rekombinantās DNS tehnoloģiju. Transgēnus organismus ražo, ievadot organismos svešus gēnus (transgēnus), izmantojot biotehnoloģiju. Tos sauc arī par ģenētiski modificētiem organismiem. Transgēnie organismi ir vērtīgi pētījumu instrumenti. Tie ir svarīgi gēnu funkcijas izpētē, kā arī gēnu terapijā un lauksaimniecībā. Peles tiek izmantotas kā laboratorijas dzīvnieku modeļi, jo tās ir ciešāk saistītas ar cilvēkiem. Transgēnās peles un nokautās peles ir divu veidu ģenētiski modificēti dzīvnieki. Transgēnās pelēs saimnieka DNS lokusā tiek aizstāts ar citu tā paša gēna vai pilnīgi atšķirīga gēna versiju. Nokautās pelēs saimniekgēns tiek vienkārši izdzēsts vai funkcionāli inaktivēts.
