Galvenā atšķirība starp prokariotu un eikariotu DNS ir tā, ka prokariotu DNS brīvi peld citoplazmā, kamēr eikariotu DNS atrodas kodola iekšpusē.
Ir divas galvenās dzīvo organismu kategorijas, piemēram, prokarioti un eikarioti. Viņi savā starpā atšķiras ar šūnu organizāciju. Attiecīgi prokariotiem ir vienkārša šūnu organizācija. Viņiem trūkst kodola un ar membrānu saistītu organellu. No otras puses, eikariotiem ir sarežģīta šūnu organizācija. Viņiem ir patiess kodols, kas satur DNS un arī ar membrānu saistītos šūnu organoīdus. Visi prokarioti ir vienšūnas, bet eikarioti var būt vienšūnas vai daudzšūnu organismi. Prokarioti un eikarioti galvenokārt satur DNS genomus. Viņu DNS ir iesaiņots hromosomās. Tā kā prokariotiem nav kodola, to DNS brīvi peld citoplazmā. Tomēr eikariotos hromosomas atrodas kodola iekšpusē. Tādējādi kodola membrāna aptver visu eikariotu DNS.