Galvenā atšķirība starp bioloģisko kontroli un ķīmisko kontroli ir tā, ka bioloģiskajā kontrolē kaitīgo organismu iznīcināšanai tiek izmantots dzīvs organisms, savukārt ķīmiskajā kontrolē kaitēkļu iznīcināšanai tiek izmantotas dažādas sintētiskas ķīmiskas vielas.
Kaitēkļi ir mazas radības, kas ievaino, kaitē vai nogalina augus vai mājdzīvniekus. Turklāt tie pārnēsā slimības, rada ekonomiskus zaudējumus utt. Kaitēkļi uzbrūk dažādām kultūrām un rada milzīgus zaudējumus lauksaimniecībā. Tāpēc kaitēkļu apkarošana ir grūts uzdevums, un to kontrolē, izmantojot ķīmiskas metodes. Tomēr ķīmiskās vielas nav videi draudzīgas. Tie rada vides problēmas, kā arī veselības problēmas. Tāpēc zinātnieki ir izstrādājuši videi draudzīgas un ilgtspējīgas bioloģiskās kaitēkļu kontroles metodes. Bioloģiskajā kontrolē iesaistīts dzīvs organisms vai organismu grupa. Tādējādi to ietekme uz vidi ir mazāka. Ķīmiskā kontrole var kaitēt videi un izraisīt veselības problēmas.
