Galvenā atšķirība starp eksencefaliju un anencefaliju ir tā, ka eksencefalija ir cefālijas slimība, kurā smadzeņu audi atrodas ārpus galvaskausa, jo nav galvaskausa dobuma un galvas ādas. Tikmēr anencefalija ir cefālijas slimība, kurai raksturīga smadzeņu, galvaskausa un galvas daļas lielākās daļas trūkums, jo rostrālā neiropora nav spējīga aizvērt.
Iedzimti traucējumi rodas nervu defektu dēļ, kas notiek grūtniecības laikā. Tie izraisa augstu mirstības pakāpi, padarot stāvokli letālu. Exencefalija un anencefalija ir divi šādi iedzimti traucējumi, kā arī cefālijas traucējumi, kas novērojami zīdaiņiem. Eksencefalijā smadzenes atrodas ārpus galvaskausa. Anencefalijā nav lielas smadzeņu, galvaskausa un galvas daļas. Eksencefalija tiek uzskatīta par anencefalijas embrioloģisko priekšteci. Tomēr eksencefalija ir ārkārtīgi rets stāvoklis, salīdzinot ar anencefaliju.
