Galvenā atšķirība starp bakteriocīnu un antibiotiku ir tā, ka bakteriocīns ir olbaltumvielu toksīns, ko baktērijas ražo pret cieši saistītu baktēriju celmu, savukārt antibiotika ir antibakteriāla viela un sekundārs metabolīts, kas iznīcina vai kavē baktēriju augšanu.
Pretmikrobu vielām piemīt spēja iznīcināt patogēnos mikroorganismus vai palēnināt to augšanu un vairošanos. Pretmikrobu līdzekļi var būt antibakteriāli, pretsēnīšu vai pretvīrusu līdzekļi. Antibakteriālas vielas vai antibiotikas darbojas pret baktērijām, bet pretsēnīšu vielas - pret patogēnām sēnēm. Pretvīrusu zāles iznīcina vīrusus. Tādēļ antibiotikas ir visefektīvāko antibakteriālo vielu veids, ko var izmantot, lai apkarotu bakteriālas infekcijas. Bakteriocīns ir olbaltumvielu toksīns, ko ražo baktērijas. Tas darbojas pret cieši saistītiem baktēriju celmiem. Tādējādi gan antibiotikām, gan bakteriocīnam piemīt antibakteriāla aktivitāte.
