Galvenā atšķirība starp daudzšūnu un vienšūnu ir tāda, ka daudzšūnu organismiem ir vairāk nekā viena šūna, kamēr vienšūnu organismiem ir tikai viena šūna.
Pamatojoties uz šūnu skaitu, ir divas organismu kategorijas. Proti, tie ir vienšūnas un daudzšūnu organismi. Vienšūnu un daudzšūnu organismu uzvedība, anatomija un funkcionalitāte atšķiras. Daudzšūnu organismi ir organismi, kas sastāv no vairāk nekā vienas šūnas. Tie ir sarežģīti organismi, kuriem ir dažādas funkcijas. No otras puses, vienšūnas organismus sauc arī par vienšūnas organismiem, kas sastāv tikai no vienas šūnas. Tādējādi viņiem ir vienkārši bioloģiski procesi.