Galvenā atšķirība starp makroskopisko un mikroskopisko ir tā, ka termins makroskopisks attiecas uz vielām, kas ir redzamas ar neapbruņotu aci, savukārt termins mikroskopisks attiecas uz vielām, kuras nav redzamas ar neapbruņotu aci.
Termini makroskopisks un mikroskopisks attiecas uz divām dažādām skalām, kas ir noderīgas, lai noteiktu dažādu savienojumu lielumu. Makroskopiskās vielas ir pietiekami lielas, lai tās varētu redzēt ar neapbruņotu aci bez palielinoša instrumenta. Gluži pretēji, mikroskopiskās vielas ir ļoti mazas, un tās nav tik lielas, lai tās varētu redzēt ar neapbruņotu aci. Tādējādi, lai pārbaudītu šīs vielas, mums ir nepieciešams palielinošs instruments, piemēram, mikroskops.