Galvenā atšķirība starp Elisa un Western blot ir tā, ka Elisa vai ar enzīmiem saistīta imūnanalīze ir diagnostikas rīks, kas nosaka, vai pacients ir pakļauts noteikta veida vīrusa vai cita infekcijas izraisītāja iedarbībai, savukārt Western blot ir metode, kas nosaka specifisku olbaltumvielu no olbaltumvielu paraugs.
AIDS ir kļuvusi par globālu problēmu, un pēdējās desmitgadēs šīs nāvējošās slimības sastopamība ir satraucoši pieaugusi. HIV testi atklāj cilvēka imūndeficīta vīrusa ((HIV) klātbūtni, kas izraisa šo sindromu. No dažādiem HIV testiem ELISA un Western Blot šodien ir ļoti populāri. ELISA apzīmē ar enzīmiem saistītu imūnsorbentu testu, kas ir uz plāksnēm balstīta testa metode. Tas ir enzīma imunoloģiskais tests, ko izmanto HIV antivielu noteikšanai. Western blot nosaka noteiktu olbaltumvielu no olbaltumvielu maisījuma, izmantojot iezīmētas antivielas.