Galvenā atšķirība starp organisko un neorganisko sēru ir tā, ka organiskais sērs attiecas uz sēru, kas atrodas organiskajos savienojumos, kas ir ļoti nekustīgs augsnē, savukārt neorganiskais sērs attiecas uz sēru, kas atrodas neorganiskajos savienojumos, kas ir ļoti kustīgs augsnē.
Organiskais un neorganiskais sērs ir divi termini, kurus mēs bieži lietojam augsnes ķīmijā. Sērs augsnē var rasties divos veidos kā organiskais un neorganiskais sērs, atkarībā no savienojuma veida, pie kura ir piesaistīti sēra atomi. Šie sēru saturošie savienojumi cirkulē caur augsnes sistēmām, izmantojot dažādas metodes, piemēram, mobilizāciju, imobilizāciju, mineralizāciju, oksidēšanu un reducēšanu.