Galvenā atšķirība starp aktīvajām dūņām un noplūdes filtru ir tā, ka aktīvās dūņas ir suspendēta kultūras sistēma, kurā biomasa tiek sajaukta ar notekūdeņiem, savukārt filtrējošais filtrs ir pievienota kultūras sistēma, kurā biomasa tiek audzēta uz barotnēm un notekūdeņi tiek izvadīti pa tās virsmu.
Notekūdeņu attīrīšana ir kritisks process, lai novērstu ūdens izraisītās slimības un uzturētu veselīgu vidi ikvienam. Mikroorganismi, īpaši baktērijas, tiek izmantoti notekūdeņu attīrīšanas procesos. Notekūdeņu bioloģiskajā attīrīšanā papildus baktērijām piedalās arī nematodes un citi mazi organismi.