Galvenā atšķirība starp viroīdo un virusoīdo ir tā, ka viroīds ir mazs infekcijas izraisītājs, kas sastāv tikai no vienpavediena RNS, savukārt virusoīds ir infekciozs apļveida vienvirziena RNS, kam šūnas inficēšanai nepieciešams palīgvīruss.
Viroīds un virusoīds ir divu veidu infekcijas daļiņas, kas sastāv no vienvirziena RNS. Tie atšķiras no vīrusiem, jo tiem nav olbaltumvielu apvalka. Tomēr, līdzīgi kā vīrusi, tie nespēj sevi atkārtot. Tādēļ viņiem ir nepieciešama saimniekorganisma šūna, lai tie varētu vairoties. Turklāt viroīdi un virusoīdi ir mazākie subvīrusu replikoni.
