Galvenā atšķirība starp skābekli un oglekļa dioksīdu ir tā, ka skābeklis ir divcilmes molekula, kurai ir divi skābekļa atomi, savukārt oglekļa dioksīds ir triatomiska molekula, kurai ir viens oglekļa atoms un divi skābekļa atomi.
Skābekļa un oglekļa dioksīda gāzes ir divas būtiskas sastāvdaļas zemes atmosfērā. Tas ir saistīts ar tā nozīmi dzīvajiem organismiem. Tāpat elpošanai mums ir nepieciešams skābeklis, un elpošanas procesā izdalās oglekļa dioksīds. Mums ir nepieciešams šis ieelpotais skābeklis, lai ražotu enerģiju (ATP) dzīvo šūnu iekšpusē no procesa, kas pazīstams kā šūnu elpošana. No otras puses, augi ogļhidrātu ražošanai fotosintēzē izmanto oglekļa dioksīdu. Tātad augi ir iesaistīti skābekļa, oglekļa dioksīda līdzsvara uzturēšanā atmosfērā.