Galvenā atšķirība starp polimēru un makromolekulu ir tā, ka polimērs ir makromolekula ar atkārtotu vienību, ko sauc par monomēru visā molekulārajā struktūrā, turpretī ne katras makromolekulas struktūrā ir monomērs.
Atšķirība starp polimēru un makromolekulām izriet no fakta, ka polimērs ir makromolekulas apakšnodaļa. Makromolekulas ir ārkārtīgi lielas molekulas ar lielu molekulmasu. Turklāt mēs varam sadalīt makromolekulu divās galvenajās kategorijās atbilstoši tās struktūrai. Proti, tās ir polimerizētas un nepolimerizētas molekulas. No otras puses, polimērs veidojas no nelielu molekulu polimerizācijas, kas ir monomēri. Bet visas makromolekulas nesatur monomēra vienību, kas atkārtojas visā tās struktūrā.