Galvenā atšķirība starp acetil CoA un acil CoA ir tā, ka acetil CoA (vai acetil koenzīms A) palīdz olbaltumvielu, ogļhidrātu un lipīdu metabolismā, savukārt acil CoA (vai acil koenzīms A) taukskābju metabolismā.
Acetil CoA ir ļoti noderīgs, piegādājot acetilgrupu Krebsa ciklā enerģijas ražošanai. Acetilgrupas grupa ir funkcionāla grupa, kam ķīmiskā formula ir -C (O) CH 3. Acilgrupa ir arī funkcionālā grupa ar ķīmisko formulu –C (O) R, kur R grupa ir taukskābju sānu ķēde. Tas ir noderīgs enerģijas ražošanā, pārveidojot par acetil CoA.
