Galvenā atšķirība - baktēriju transposāzes salīdzinājumā ar retrovīrusu integrāzēm
Pārnēsājamais ģenētiskais materiāls ir attīstījies ar divām galvenajām stratēģijām, lai pārietu no viena reģiona uz nākamo reģionu iekšpusē un starp genomiem. Viena no metodēm ir izspiest caur RNS molekulu pirms DNS molekulas veidošanās, bet otrs ceļš ietver DNS starpproduktus. Transposāzes un vīrusu integrāzes ir šāda transponējama ģenētiskā materiāla piemēri. Baktēriju transposāzes saistās ar transpozonu galu un ar dažādu mehānismu palīdzību atvieglo transpozona kustības katalizēšanu uz citu genoma daļu. Retrovīrusu integrāzes ir fermenti, kas palīdz integrēt retrovīrusa, piemēram, HIV, ģenētisko materiālu inficētās saimniekšūnas ģenētiskajā materiālā (DNS). Šī ir galvenā atšķirība starp baktēriju transposāzēm un retrovīrusu integrāzēm.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir baktēriju transpozāzes
3. Kas ir retrovīrusu integrāzes
4. Līdzības starp baktēriju transpozāzēm un retrovīrusu integregāzēm
5. Blakus salīdzinājums - baktēriju transpozāzes vs retrovīrusu integrāzes tabulas veidā
6. Kopsavilkums
Kas ir baktēriju transposāzes?
Transposāzi var definēt kā fermentu, kas saistīts ar transpozonu galu, kas ar dažādu mehānismu starpniecību atvieglo katalizēšanu transpozona kustībā uz citu genoma daļu. Šādi mehānismi ietver “izgriešanas un ielīmēšanas mehānismu” un “replikācijas transponēšanas mehānismu”. Transposāzi vispirms ieviesa, klonējot fermentu, kas nepieciešams Tn3 transpozona transponēšanai. Transponējamie ģenētiskie elementi ir izmantojuši divas svarīgas stratēģijas pārvietošanai starp genomiem vai no vienas vietas uz otru. Transports caur RNS starpproduktu pirms DNS kopijas sintēzes ir viena stratēģija, bet otra ir saistīta tikai ar DNS starpproduktiem. Rekombinācijas reakcijas, kas iesaistītas abu elementu integrācijā, notiek elementam raksturīgo enzīmu dēļ. TādējādiDNS elementu gadījumā šie fermenti ir pazīstami kā transpozāzes, savukārt RNS elementu gadījumā tie ir pazīstami kā integrāzes.
Salīdzinot atšķirības starp abām transponēšanas stratēģijām, šķiet, ka ievietošanas process ir identisks ķīmiski. Bet jaunākie pierādījumi liecina, ka zināmas integrācijas mehānisma līdzības ir redzamas aminoskābju secību reģionos, kas veido aktīvo vietu; DDE motīvs. Pašlaik tiek klasificētas piecas transposāžu ģimenes, bet, parādoties jaunām transposāzes rakstzīmēm, ģimeņu skaits vēl ir jāpalielina. Ģimenēs ietilpst DDE transposāze, tirozīna (Y) transpozāze, serīna (S) transpozāze, riņķojošā apļa transpozāze, reversās transkriptāzes / endonukleāzes (RT / En) uc. Šīs ģimenes izmanto unikālus katalītiskos mehānismus, lai sadalītu un atkal pievienotos DNS. DDE transposāze ietver sākotnējā transpozona griešanas un ielīmēšanas mehānismu un nes trīs konservētu aminoskābju komplektus, proti;aspartāts (D), aspartāts (D) un glutamāts (E). Tirozīna transposāzes iesaistās arī griešanas un ielīmēšanas mehānismā, izmantojot tirozīna atlikumus, kas ir specifiski vietnei.
01. attēls: Baktēriju transposāzes
Serīna transposāzes ietver apļveida DNS starpproduktu un veic griešanas un ielīmēšanas mehānismu tāpat kā iepriekš minētās ģimenes. Ritošā apļa transpozāze iekļauj kopēšanas mehānismā, kad viena virkne tiek tieši nokopēta mērķa vietā, izmantojot DNS replikāciju. Tas nodrošina, ka veidnes virknei un kopētajai virknei ir jauna sintezēta virkne. Reversās transkriptāzes / endonukleāzes transposāzes transponēšanai ir dažādi mehānismi.
Kas ir retrovīrusu integrāzes?
Retrovīrusu integrāzes kontekstā tas tiek uzskatīts par retrovīrusu enzīmu, kas palīdz integrēt retrovīrusu, piemēram, HIV, ģenētisko materiālu inficētās šūnas ģenētiskajā materiālā (DNS). Šīs retrovīrusu integrāzes visbiežāk tiek sajauktas ar fāgu integrāzēm. Fāgu integrāžu piemēri ir λ fāgu integrāze. Bet tie ir pilnīgi atšķirīgi fermenti, un tos nevajadzētu sajaukt. Attiecībā uz retrovīrusu pirmsintegrācijas kompleksa veidošanos galvenā loma ir retrovīrusu integrāzei. Retrovīrusu integrāzes proteīni parasti sastāv no trim (03) kanoniskiem domēniem. Šos domēnus savieno elastīgi saites.
Trīs domēni ietver N gala cinku saistošo domēnu, kur trīs spirālveida saišķi ir savienoti un stabilizēti, koordinējot, iesaistot Zn 2+katjonu, RNāzes H reizes katalītiskā kodola domēnu un C gala DNS saistošo domēnu, kas ir SH3 reizes. Izmeklējot un izmantojot bioķīmisko un strukturālo informāciju, tas liek domāt, ka retrovīrusu integrāzei ir spēja darboties kā dimmeru dimēram (tetrameram). Multimerizācijas un vīrusa DNS saistīšanas kontekstā visi trīs retrovīrusu integrāzes proteīna domēni. Retrovīrusu integrāzes galvenā funkcija ir ievietot tās ģenētisko materiālu DNS uzņemšanai. Šis solis ir vissvarīgākais solis HIV vīrusa vīrusa replikācijā. Kad tas būs veiksmīgi integrēts, tas atradīsies šūnas hromosomu DNS visu atlikušo mūžu.
02. attēls: retrovīrusu integrāzes
Tāpēc pēc integrēšanas šūna neatgriežas. Šīs retrovīrusu integrāzes ir saistītas ar divu galveno reakciju katalizēšanu, ieskaitot 3 'gala apstrādi un kovalentu ligāciju. 3 'galīgās apstrādes laikā 2-3 nukleotīdi no vīrusa DNS abiem 3' galiem tiek noņemti, lai atklātu vīrusa DNS 3 'galu CA dinukleotīdus, un kovalentās ligēšanas laikā apstrādātie 3' gali vīrusa DNS tiek kovalenti sasaistīti saimnieka hromosomu DNS.
Kāda ir baktēriju transpozāžu un retrovīrusu integrāžu līdzība?
Gan baktēriju transposāzēm, gan retrovīrusu integrāzēm ir līdzīgas aminoskābju secības
Kāda ir atšķirība starp baktēriju transposāzēm un retrovīrusu integrāzēm?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
Baktēriju transposāzes pret retrovīrusu integrāzēm |
|
| Baktēriju transpozāze ir ferments, kas saistīts ar transpozonu galu, vienlaikus ar dažādiem mehānismiem veicinot transpozona kustības katalizēšanu uz citu genoma daļu. | Retrovīrusu integrāzes tiek uzskatītas par retrovīrusu enzīmu, kas palīdz integrēt retrovīrusu ģenētisko materiālu, piemēram, HIV, inficētās šūnas ģenētiskajā materiālā (DNS). |
| Saistošie reģioni | |
| Baktēriju transposāzēm ir nepieciešami īpaši specifiski saistošie reģioni. | Saistīšanai nepieciešama mazāka nukleotīdu secība vai tās nav. |
Kopsavilkums - baktēriju transposāzes salīdzinājumā ar retrovīrusu integrāzēm
Baktēriju transpozāzes tiek uzskatītas par retrovīrusu enzīmu, kas palīdz integrēt retrovīrusu ģenētisko materiālu, piemēram, HIV, inficētās šūnas ģenētiskajā materiālā (DNS). Transponējamie ģenētiskie elementi ir izmantojuši divas svarīgas stratēģijas pārvietošanai starp genomiem vai no vienas vietas uz otru. Pašlaik tiek klasificētas piecas transposāžu ģimenes, bet, parādoties jaunām transposāzes rakstzīmēm, ģimeņu skaits vēl ir jāpalielina. Retrovīrusu integrāze tiek uzskatīta par retrovīrusu enzīmu, kas palīdz integrēt retrovīrusa, piemēram, HIV, ģenētisko materiālu inficētās šūnas ģenētiskajā materiālā (DNS). Retrovīrusu integrāzes proteīni parasti sastāv no trim (03) kanoniskiem domēniem. Retrovīrusu integrāzes galvenā funkcija ir ievietot tās ģenētisko materiālu DNS uzņemšanai. Šis solis ir vissvarīgākais solis HIV vīrusa vīrusa replikācijā. Tāpēc pēc integrēšanas šūna neatgriežas. Šī ir atšķirība starp baktēriju transposāzēm un retrovīrusu integrāzi.
Lejupielādējiet PDF failu Baktēriju transposāzes pret retrovīrusu integrāzēm
Jūs varat lejupielādēt šī raksta PDF versiju un izmantot to bezsaistes mērķiem, kā norādīts piezīmē. Lūdzu, lejupielādējiet PDF versiju šeit: Starpība starp baktēriju transposāzēm un retrovīrusu integrāzēm
