Galvenā atšķirība starp kvantu bioloģiju un ķīmiju ir tā, ka kvantu bioloģija ir jauna zinātnes disciplīna, kas ietver kvantu mehānikas un teorētiskās ķīmijas pielietošanu bioloģijas aspektos, savukārt ķīmija ir zinātne, kas pēta vielas sastāvu, struktūru un īpašības.
Kvantu bioloģija un ķīmija ir divas zinātnes nozares. Kvantu bioloģija ir kvantu mehānikas pielietošana bioloģiskajos procesos. Ķīmija nodarbojas ar vielu īpašībām, sastāvu un struktūru un to pārveidošanu. Tāpēc ķīmijas pētījumiem ir nozīme, savukārt kvantu bioloģija koncentrējas uz bioloģiskajiem procesiem, kuriem pēc būtības ir kvantu mehānika.