Galvenā atšķirība starp alfa un beta anomēriem ir tāda, ka alfa anomērā hidroksilgrupa pie anomēra oglekļa ir cis pret eksociklisko skābekli anomēra centrā, bet beta anomērā hidroksilgrupa ir trans uz eksociklisko skābekli.
Anomērs ir ģeometriska variācija starp ogļhidrātiem. Tas ir epimēra veids, kurā mēs varam redzēt anomēru oglekļa atomu. Anomēra oglekļa atoms tiek iegūts no ogļhidrātu atvērtās ķēdes struktūras karboniloglekļa. Tāpēc cikliskās struktūras veidošanos no atvērtās ķēdes struktūras sauc par anomerizāciju.