Galvenā atšķirība starp kopējo šūnu skaitu un dzīvotspējīgo šūnu skaitu ir tāda, ka kopējais šūnu skaits aplēš visas šūnas, iekļaujot gan dzīvās, gan mirušās mikrobu šūnas paraugā, savukārt dzīvotspējīgo šūnu skaits nosaka tikai dzīvās mikrobu šūnas paraugā.
Organismu skaita skaitīšana populācijā tiek uzskatīta par nepieciešamu lielākajai daļai eksperimentālo darbu. Tāpēc mēs mēģinām analizēt mikrobu skaitu paraugā, izmantojot tiešas un netiešas metodes. Tiešie mērījumi ietver metodes, kas tieši skaita šūnu skaitu. Netiešie mērījumi ietver dažu parametru, kas var būt saistīti ar šūnu skaitu, mērīšanu, piemēram, šūnu blīvumu, sauso svaru utt. Dažas metodes kvantitatīvi nosaka tikai dzīvās mikrobu šūnas paraugā. Dzīvotspējīgo šūnu skaits ir viena no šādām metodēm. Tiešie mikroskopiskie skaitījumi, izmantojot mikroskopu, nosaka visas šūnas zināmā barotnes / parauga tilpumā. Tāpēc tas skaita gan dzīvās, gan mirušās šūnas. Tas ir kopējais šūnu skaits.