Galvenā atšķirība starp primāro un sekundāro kinētisko izotopu efektu ir tā, ka primārais izotopu efekts apraksta izotopu aizstāšanu pie sašķeltās saites, bet sekundārais izotopu efekts apraksta izotopu aizvietojumu pie saites, kas atrodas blakus šķeltajai saitei.
Kinētiskā izotopa efekts jeb KIE attiecas uz ķīmiskās reakcijas reakcijas ātruma izmaiņām pēc izotopu aizstāšanas. Šeit reaktanta atoms tiek aizstāts ar tā izotopu, tāpēc reakcijas ātrums būtu atšķirīgs no sākotnējā ātruma. Tad mēs varam noteikt KIE vērtību, dalot ātruma konstanti reakcijai, kurā iesaistīts vieglais izotopā aizvietots reaģents, no ātruma konstantes reakcijai, kurā iesaistīts smagais izotopā aizvietotais reaģents. Tāpēc KIE, kas lielāks par 1, tiek uzskatīts par normālu kinētisko izotopisko efektu, savukārt KIE, kas mazāks par 1, tiek uzskatīts par apgrieztu kinētisko izotopu efektu.
