Galvenā atšķirība - Microarray vs nākamās paaudzes secība
DNS sekvencēšanas procesi tiek plaši izmantoti biotehnoloģijas, viroloģijas, medicīniskās diagnostikas un tiesu medicīnas jomā. Tas ir process, kas nosaka precīzu DNS molekulā esošo nukleotīdu, adenīna, guanīna, timīna un citozīna secību. DNS sekvencēšanas procedūras ir kļuvušas par brīnumainu atklājumu paātrinātāju medicīniskajos un bioloģiskajos pētījumos. Šīs sekvencēšanas metodes ir attīstījušās līdz atsevišķu organismu, tostarp cilvēku un citu dzīvo sugu, pilnīga genoma sekvencēšanai. Mikrouzņēmumi un nākamās paaudzes secība ir modernas DNS sekvencēšanas procedūras. Microarray tehnika ir īpaši balstīta uz hibridizāciju, kas satur zināmu mērķu kopumu. Nākamās paaudzes sekvencēšana balstās uz sintēzi (kurā nukleotīdu iekļaušanai tiek izmantota DNS polimerāze), un tai ir iespēja sekvencēt visu genomu neatkarīgi no iepriekš atlasītajiem mērķiem. Šī ir galvenā atšķirība starp Microarray un nākamās paaudzes secību.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir Microarray
3. Kas ir nākamās paaudzes secība
4. Microarray un nākamās paaudzes secības līdzības
5. Blakus salīdzinājums - Microarray vs nākamās paaudzes secība tabulas veidā
6. Kopsavilkums
Kas ir Microarray?
DNS mikroelements tiek izmantots kā laboratorijas līdzeklis, lai vienlaikus identificētu tūkstošiem dažādu gēnu izpausmju. Tā ir cieta virsma, ti, mikroskopa slaids, kas satur uz tā iespiestu mikroskopisku DNS plankumu kolekciju. Katrā iespiestajā vietā ir zināma gēnu secība vai gēns. Šīs zināmās zondes, kas uzdrukātas uz priekšmetstikliņa, kalpo kā zondes, lai noteiktu gēnu ekspresiju. Tas ir pazīstams kā stenogramma. Hibridizācija starp diviem DNS pavedieniem ir primārais princips, uz kura balstās mikroelementi. Tas ir nukleīnskābju secību papildinošais bāzes savienojums ar ūdeņraža saišu veidošanos.
01. attēls: Microarray
Sākotnēji mRNS molekulas tiek savāktas no eksperimenta parauga un etalona parauga, kas iegūts no veselīga indivīda. Eksperimentālos paraugus iegūst no slimām personām; piemēram, indivīds, kas cieš no vēža. Pēc iegūšanas abi mRNS paraugi tiek pārveidoti par cDNS (komplementārā DNS). Pēc tam katrs paraugs tiek marķēts, izmantojot fluorescējošu zondi. Fluorescējošām zondēm ir dažādas krāsas, lai atšķirtu parauga cDNS no atsauces cDNS. Lai sāktu cDNS molekulu saistīšanos ar mikrolainu priekšmetstikliņu, abus paraugus sajauc kopā. Hibridizācija ir process, kurā cDNS molekulas tiek piesaistītas DNS zondēm uz mikroelementu slaida. Kad hibridizācija ir pabeigta,notiek virkne reakciju, lai identificētu un izmērītu katra gēna izpausmi ar dažādu krāsu izskatu atbilstoši izteiktā gēna daudzumam. Microarray rezultātus izmanto, lai izveidotu gēnu ekspresijas profilu, ko var izmantot dažādu slimības apstākļu identificēšanai.
Kas ir nākamās paaudzes secība?
Nākamās paaudzes secība (NGS) ir uzlabota ģenētiskās sekvencēšanas metode. Tās princips ir līdzīgs Sangera sekvencēšanas principam, kas ir atkarīgs no kapilārās elektroforēzes. NGS genomiskā virkne ir sadrumstalota un saistīta ar šablona virkni. Katras virknes pamatus identificē pēc izstarotajiem signāliem tās sasaistīšanas procesā. Sangera sekvencēšanas metodē ir iesaistīti trīs atsevišķi soļi, sekvencēšana, atdalīšana un noteikšana. Šo atsevišķo darbību dēļ parauga sagatavošanas automatizācija ir ierobežota. NGS metodika tiek izstrādāta, izmantojot secību, kas balstīta uz masīviem, un kombinējot Sangera sekvencēšanas procedūras darbības, kas var izraisīt miljoniem reakciju virkņu paralēlu izpildi vienlaikus; tas rada lielu ātrumu un caurlaidspēju par zemām izmaksām.
02. attēls: NGS attīstība
NGS sastāv no trim posmiem; bibliotēkas sagatavošana (bibliotēku izveide, izmantojot nejaušu DNS fragmentāciju), amplifikācija (bibliotēkas pastiprināšana, izmantojot klonu amplifikāciju un PCR) un sekvencēšana. Genoma sekvencēšanas procesus, kas tiek veikti ļoti ilgu laiku, izmantojot Sangera sekvencēšanas procedūru, varētu pabeigt dažu stundu laikā, izmantojot NGS.
Kāda ir līdzība starp Microarray un nākamās paaudzes secību?
Gan Microarray, gan nākamās paaudzes secība tiek izstrādāta, izmantojot secību, kas balstīta uz masīviem
Kāda ir atšķirība starp Microarray un nākamās paaudzes secību?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
Microarray vs nākamās paaudzes secība |
|
| Microarray ir mikroskopisku DNS plankumu kolekcija, kas piestiprināta pie cietas virsmas, ko izmanto, lai vienlaikus mērītu liela skaita gēnu ekspresijas līmeni. | NGS (nākamās paaudzes sekvencēšana) ir uz Sangera balstīta augstas caurlaidspējas DNS sekvencēšanas tehnoloģija, kas atvieglo miljoniem vai miljardiem DNS virkņu paralēlu sekvencēšanu. |
| Mijiedarbība ar antigēnu | |
| Microarray pamatā ir hibridizācija, kas sastāv no zināmu mērķu kopuma. | NGS pamatā ir sintēze, kurā DNS polimerāze tiek izmantota nukleotīdu iekļaušanai, un tā nav atkarīga no iepriekš izvēlētiem mērķiem. |
Kopsavilkums - Microarray vs nākamās paaudzes secība
Pētījumu kontekstā DNS sekvencēšana ir kļuvusi par nozīmīgu paātrinātāju. To plaši izmanto biotehnoloģijā, medicīniskajā diagnostikā un kriminālistikas pētījumos. Tas ir attīstījies un attīstījies par efektīvākām un ātrākām sekvencēšanas procedūrām. Microarrays un NGS ir divas uzlabotas DNS sekvencēšanas metodes. Abi tiek izstrādāti, izmantojot secību, kas balstīta uz masīvu. Microarray tehnika balstās uz hibridizāciju, savukārt NGS ir balstīta uz sintēzi, kurā nukleotīdu iekļaušanai tiek izmantota DNS polimerāze. Šī ir galvenā atšķirība starp Microarray un nākamās paaudzes secību.
Lejupielādēt Microarray vs nākamās paaudzes secības PDF versiju
Jūs varat lejupielādēt šī raksta PDF versiju un izmantot to bezsaistes vajadzībām, kā norādīts piezīmē. Lūdzu, lejupielādējiet PDF versiju šeit Starpība starp mikrouzņēmumu un nākamās paaudzes secību
