Galvenā atšķirība starp visa genoma sekvencēšanu un eksoma sekvencēšanu ir tāda, ka visa genoma sekvencēšana sekvencē visu organisma genomu, savukārt eksoma sekvencēšana sekvencē tikai organisma eksomu vai proteīnus kodējošos gēnus.
Secība ir tehnika, kas nosaka precīzu nukleotīdu secību noteiktā DNS molekulā. Tas tikai atspoguļo pareizo četru pamatu secību; adenīns (A), guanīns (G), citozīns (C) un timīns (T) DNS fragmentā. Ir vairākas sekvencēšanas metodes, piemēram, Sanger sekvencēšana, nākamās paaudzes sekvencēšana utt. Turklāt sekvencēšanu var veikt vai nu pilnīgs organisma genoms (visa genoma sekvencēšana), vai tikai genomā esošie proteīnus kodējošie gēni (exome sekvencēšana).
