Galvenā atšķirība starp hierarhisko un visa genoma šautenes secību ir tā, ka hierarhiskā šautenes secībā pirms sekvencēšanas genoms tiek sadalīts lielākos fragmentos, savukārt visa genoma bises secībā viss genoms tiek sadalīts mazos fragmentos sekvencēšanai.
Sekvencēšana ir svarīgs paņēmiens molekulārajos procesos, īpaši precīzā sugu identificēšanā. Faktiski tā ir nukleotīdu precīzas secības noteikšanas metode gēnā vai genomā. Sekvencēšanai ir daudz paņēmienu. Daži no tiem ietver Maxam Gilbert metodi, Sanger metodi un automatizēto Sanger metodi.
