Galvenā atšķirība starp alelopātiju un antibiozi pamatojas uz katras parādības radītā efekta veidu. Alelopātija rada gan pozitīvu, gan negatīvu ietekmi uz divu vai vairāku organismu attiecībām, savukārt antibioze negatīvi ietekmē vienu no attiecībās iesaistītajiem organismiem.
Uzturam ir svarīga loma organismu izdzīvošanā. Šajā kontekstā ir būtiska saikne starp organismiem attiecībā uz uzturvielu nepieciešamību. Gan alelopātija, gan antibioze ir attiecības, kas notiek starp diviem vai vairākiem organismiem. Tomēr viņi viens otram atbild dažādos veidos.