Galvenā atšķirība starp notohordu un mugurkaula kolonnu ir tā, ka notochord ir elastīga stienim līdzīga struktūra, kas atbalsta nervu audus apakšējos hordātos, savukārt mugurkaula kolonna ir struktūra, kas satur 33 skriemeļus, kas mugurkaulnieku augstākajā hordātā iet no galvaskausa līdz pat iegurnim dzīvnieki.
Gan notohords, gan mugurkaula ir akordu iezīmes. Šīs divas struktūras stiepjas no galvas līdz astei ķermeņa muguras rajonā. Turklāt abi piedalās dažādās funkcijās un spēlē galvenās lomas ķermenī. Tādējādi šis raksts izceļ atšķirību starp notohordu un mugurkaula kolonnu.
