Galvenā atšķirība starp fotobiontu un mikobiontu ir tā, ka fotobionts attiecas uz ķērpju fotosintētisko komponentu, kas ir zaļā aļģe vai zilaļģes, savukārt mikobionts attiecas uz ķērpju sēnīšu sastāvdaļu, kas galvenokārt ir ascomicīts vai bazidiomicīts.
Starp dzīvajiem organismiem pastāv dažādu veidu simbiotiskas attiecības. Simbiotiskās attiecības ir asociācija, kurā kopā dzīvo divas dažādas organismu sugas. Turklāt parazītisms, savstarpīgums un komensālisms ir trīs simbiotisko attiecību veidi. Savstarpīgums ir izdevīgs abām pusēm. Ķērpji ir tāda veida savstarpēja asociācija, kas pastāv starp aļģēm / zilaļģēm un sēnīti. Šajā asociācijā viena puse ir atbildīga par pārtikas ražošanu fotosintēzes ceļā, bet otra puse ir atbildīga par ūdens absorbciju un pajumtes nodrošināšanu. Pamatojoties uz to, aļģes / cianobaktērijas ir pazīstamas kā fotobionti, kas veic fotosintēzi, savukārt sēne ir pazīstama kā mikobionts, kas nodrošina pajumti un absorbē ūdeni.
