Galvenā atšķirība starp mikrofāgu un makrofāgu ir tāda, ka mikrofāgs ir mazu fagocītu veids, kas dzīvo tikai dažas dienas, savukārt makrofāgs ir lielāks fagocīts ar ilgāku mūžu.
Mūsu imūnsistēma cīnās ar iebrucējiem patogēniem mikroorganismiem un uztur mūs drošībā. Tādējādi tā ir sarežģīta sistēma, kas realizē daudz un dažādus aizsardzības mehānismus, lai atklātu iebrucējus un tos iznīcinātu. Fagocitoze ir viens no mehānismiem, kurā fagocīti uzņem iebrukušās daļiņas un tās iznīcina. Fagocīti ir šūnas, kas spēj absorbēt un absorbēt baktērijas, un citas svešas šūnas un infekcijas daļiņas tajās iznīcina. Attiecīgi ir divi galvenie fagocītu veidi, proti, mikrofāgs un makrofāgs. Mikrofāgs ir mazs polimorfonukleārais fagocīts, kas sastopams lielā skaitā. No otras puses, makrofāgs ir fagocītu veids, kas izvietots vairākās svarīgās vietās mūsu ķermenī, lai darbotos kā frontālais aizsardzības mehānisms pret iebrūkošajām daļiņām. Viņi ir lielākie ēdāji mūsu imūnsistēmā.