Galvenā atšķirība starp kalcija hipohlorītu un nātrija hipohlorītu ir tā, ka kalcija hipohlorīts satur divus hipohlorīta anjonus, kas saistīti ar vienu kalcija katjonu, savukārt nātrija hipohlorīts satur vienu hipohlorīta anjonu, kas saistīts ar vienu nātrija katjonu. Pēc izskata kalcija hipohlorīts ir balts vai pelēks pulveris, bet nātrija hipohlorīts ir zaļgani dzeltena cieta viela ar saldu smaržu.
Kalcijs un nātrija hipohlorīts ir jonu savienojumi, kas satur metāla katjonu un no hlora atvasinātu anjonu. Šo savienojumu anjonu skaits vienā katjonā atšķiras pēc metāla katjona valences.
