Galvenā atšķirība starp MS un Laima slimību ir tā, ka Laima slimība ir infekcijas slimība, savukārt MS nav iekaisuma slimība, kurai nav infekcijas izcelsmes. Tas ir, multiplā skleroze ir hroniska autoimūna T-šūnu izraisīta iekaisuma slimība, kas ietekmē centrālo nervu sistēmu. Laima slimību savukārt izraisa spirohete ar nosaukumu Borrelia burgdoferi, kas cilvēka ķermenī nonāk caur utu vai ērču kodumiem.
Gan multiplā skleroze, gan Laima slimība ir slimības, kas var ietekmēt mūsu neiroloģisko sistēmu.