Galvenā atšķirība starp pārejošu un līdzsvarotu polimorfismu balstās uz alēļu uzvedību. Pārejošs polimorfisms ir viena gēna alēles pakāpeniska aizstāšana ar citu alēli, savukārt līdzsvarots polimorfisms ir abu divu dažādu gēnu alēļu uzturēšana laika gaitā
Ģenētiskais polimorfisms ir viens vai divi vai vairāki konkrētas DNS varianti. Pārejošs un līdzsvarots polimorfisms ir divu veidu polimorfisms, kas rodas divu alternatīvu gēna alēļu dēļ. Pārejošā polimorfismā no divām noteiktā lokusa alternatīvajām alēlēm vienu alēli pakāpeniski aizstāj ar citu. Līdzsvarotā polimorfismā abas alēles atrodas līdzsvarā viena ar otru. Abas gēna versijas populācijā tiek uzturētas.
