Galvenā atšķirība starp fagolizosomu un fagosomu ir tā, ka fagolizosoma ir citoplazmas ķermenis, ko veido fagosomas saplūšana ar lizosomu. Tikmēr fagosoma ir pūslīša, kas veidojas ap daļiņām, ko fagocitozes laikā absorbē fagocitārā šūna.
Fagocitoze ir aizsardzības mehānisms, ko izmanto noteiktās šūnās vai organismos, lai no ķermeņa noņemtu svešas daļiņas. Fagocīti ir šūnas, kas veic fagocitozi. Fagocīti ir leikocītu veidi, it īpaši asinīs esošie neitrofīli, monocīti un makrofāgi. Šīs šūnas aizsargā ķermeni, atklājot svešas daļiņas, piemēram, baktērijas, toksīnus, mirušās un mirstošās somatiskās šūnas utt. Pēc tam fagocīti tās aprij un iznīcina. Fagocitoze ir sava veida endocitoze. Ar fagocitozi cietās daļiņas internalizējas struktūrā, ko sauc par fagosomu. Kad tie ir ieslodzīti fagosomas iekšpusē, tie saplūst ar lizosomām un veido fagolizosomas. Pēc tam, izmantojot lizosomu hidrolāzes enzīmus, fagosomas iekšienē esošās daļiņas tiek noārdītas un iznīcinātas.
