Galvenā atšķirība starp NCE un NME ir tā, ka NCE nav aktīvas daļas, kuru jebkad apstiprinājusi FDA (Pārtikas un zāļu pārvalde), turpretī NME ir aktīva daļa, kuru FDA iepriekš nav apstiprinājusi.
Terminus NCE un NME lieto, lai kategorizētu zāles pēc aktīvo daļu klātbūtnes vai neesamības, kas ir zāļu daļas, kas var ietekmēt zāļu aktivitāti. Parasti zāles ar aktīvu daļu ir terapeitiski izdevīgākas. FDA norāda, ka zāles, kas nesatur aktīvu daļu, kā iepriekš apstiprinājusi FDA, ir jauna molekulāra vienība vai NME, un zāles, kas satur aktīvo daļu, kuru apstiprinājusi FDA, ir jauna ķīmiska vienība vai NCE.
