Galvenā atšķirība starp līdzību un identitāti secības izlīdzināšanā ir tāda, ka līdzība ir līdzība (līdzība) starp divām secībām salīdzinājumā ar identitāti ir rakstzīmju skaits, kas precīzi atbilst divām dažādām secībām.
Bioinformātika ir starpdisciplināra zinātnes joma, kas galvenokārt ietver molekulāro bioloģiju un ģenētiku, datorzinātnes, matemātiku un statistiku. Sekvences pielīdzināšana ir galvenais bioinformātikas termins. Tā ir procedūra, kurā DNS, RNS vai olbaltumvielu secības tiek sakārtotas, lai identificētu līdzības reģionus, kas ir sekvenciju funkcionālo, strukturālo vai evolūcijas attiecību sekas. Līdzināšanas beigās tie tiks parādīti kā rindas matricā. Lai sakārtotu identiskās rakstzīmes secīgos kolonos, starp atlikumiem ir ievietotas atstarpes.