Galvenā atšķirība starp homoloģiju un līdzību bioinformātikā ir tā, ka homoloģija attiecas uz paziņojumu par divu secību kopīgu evolucionāru senču, savukārt līdzība attiecas uz divu secību līdzības pakāpi.
Bioinformātika ir zinātnes joma, kas apvieno bioloģiju, informācijas inženieriju, datorzinātnes, matemātiku un statistiku, lai analizētu un interpretētu bioloģiskos datus. Homoloģija un līdzība ir divi termini, kurus mēs izmantojam bioinformātikas jomā. Mēs varam viegli aprēķināt līdzību kā līdzīgu atlikumu procentuālo daudzumu noteiktā izlīdzināšanas garumā. Tomēr mēs nevaram aprēķināt homoloģiju, jo tā varētu būt patiesa vai nepatiesa un parasti atkarīga no izmantotās hipotēzes.
