Galvenā atšķirība starp alogāmiju un autogāmiju ir tā, ka alogāmija ir vīriešu un sieviešu dzimumšūnu saplūšana, kas nāk no diviem dažādiem indivīdiem, savukārt autogāmija ir viena indivīda vīriešu un sieviešu gametu saplūšana. Vēl viena atšķirība starp alogāmiju un autogāmiju attiecībā uz saražotajiem pēcnācējiem ir tā, ka alogāmija rada ģenētiski atšķirīgus pēcnācējus, bet autogāmija - ģenētiski identiskus pēcnācējus.
Vīriešu gametas saplūšana ar sieviešu dzimuma gametu ir apaugļošanās. Apaugļošanās rezultātā attīstās zigota, un pēc tam notiek šūnu dalīšanās, lai iegūtu jaunus pēcnācējus. Turklāt mēslošana var būt divu veidu; apaugļošana vai apaugļošana. Alogāmija ir savstarpējas apaugļošanas sinonīms un Autogāmija ir pašauglības sinonīms.
