Galvenā atšķirība starp šūnu un antivielu starpniecību ir tā, ka šūnu ierosinātā imunitāte iznīcina infekcijas daļiņas, citokīnu šūnās sadaloties, neradot antivielas, savukārt antivielu izraisītā imunitāte iznīcina patogēnus, ražojot specifiskas antivielas pret antigēniem.
Šūnu un imunitātes starpniecību imunitāte ir divu veidu primārie aizsardzības mehānismi, kas notiek mūsu ķermenī. Šūnu mediētā imunitāte darbojas pret intracelulāriem patogēniem. Tādējādi tas darbojas inficēto šūnu iekšienē un iznīcina patogēnus, atbrīvojot citokīnus. Turpretī antivielu mediēta imunitāte darbojas pret ārpusšūnu patogēniem, ražojot antivielas pret antigēniem, kas atrodas ārpus inficētajām šūnām vai brīvi cirkulē asinīs. Turklāt B limfocīti galvenokārt realizē imunitāti ar antivielu starpniecību, bet T limfocīti - ar šūnu starpniecību.
