Galvenā atšķirība starp kariotipu un idiogrammu ir tā, ka kariotips ir faktiskais kopējo šūnu hromosomu attēls, savukārt idiogramma ir kariotipa shematiska diagramma, kas ilustrē visas hromosomu kartes.
Hromosomu kopa atspoguļo organisma genomu un ģenētisko informāciju. Katrai hromosomai ir unikāla forma, izmērs un gēnu kopums. Hromosomu skaits un fiziskā struktūra atklāj svarīgu informāciju par organismu. Kariotipēšana ir metode, kas tiek veikta, lai pārbaudītu pilnu hromosomu komplektu šūnā. Šī testa laikā tiek savāktas un analizētas kopējās hromosomas, lai noteiktu, vai hromosomās ir skaitliskas vai strukturālas novirzes. Faktiskais attēls, kas parāda kopējās šūnas hromosomas, ir kariotips, savukārt šūnas kopējo hromosomu shematiskā diagramma ir idiogramma. Abi ir svarīgi citoģenētiskajos pētījumos.