Galvenā atšķirība starp punktu mutāciju un hromosomu mutāciju ir tāda, ka punktu mutācija ir maza mēroga mutācija, kurā mainās viens DNS vai RNS secības bāzes pāris, bet hromosomu mutācija ir liela mēroga mutācija, kurā mainās hromosomas struktūra.
Mutācija ir izmaiņas vai izmaiņas DNS vai RNS nukleotīdu secībā. Mutācijas ir galvenais organismu ģenētiskās mainības cēlonis. Mutācijas notiek somatiskajās šūnās, kā arī dzimumšūnu šūnās. Dažas mutācijas pārmanto nākamā paaudze, bet citas nav pārmantojamas. Somatiskās mutācijas ietekmē pašreizējo organismu, savukārt cilmes līnijas mutācijas tiek pārnestas uz nākamo paaudzi. Punktu mutācija un hromosomu mutācija ir divi izplatīti mutāciju veidi. Punktu mutācijas ir vienkāršākais mutāciju veids, kas rodas vienas bāzes pāra maiņas dēļ. No otras puses, hromosomu mutācijas ir nedaudz liela mēroga izmaiņas, kurās organismā mainās hromosomu struktūra vai skaits.
